Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SLC16A7-209ENST00000549465 537 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms