Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD54BQ9Y620 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms