Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms