Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX10Q9Y5X0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms