Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX11Q9Y5W9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX11Q9Y5W9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms