Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y4

PYGO1, Pygopus homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO1Q9Y3Y4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PYGO1Q9Y3Y4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PYGO1Q9Y3Y4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PYGO1Q9Y3Y4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PYGO1Q9Y3Y4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PYGO1Q9Y3Y4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PYGO1Q9Y3Y4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PYGO1Q9Y3Y4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PYGO1Q9Y3Y4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PYGO1Q9Y3Y4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PYGO1Q9Y3Y4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PYGO1Q9Y3Y4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms