Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms