Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.8 ms