Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNND2Q9UQB3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms