Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNM6

PSMD13, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD13Q9UNM6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD13Q9UNM6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD13Q9UNM6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD13Q9UNM6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms