Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP18Q9UMW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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