Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FZD4Q9ULV1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms