Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms