Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms