Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAPPC2LQ9UL33 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC2LQ9UL33 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms