Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SARDHQ9UL12 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms