Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA11Q9UKX5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA11Q9UKX5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms