Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACAD8Q9UKU7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACAD8Q9UKU7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms