Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CROTQ9UKG9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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