Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA2Q9UJY4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGA2Q9UJY4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms