Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX25Q9UHL0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms