Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPS7AQ9UBW8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COPS7AQ9UBW8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms