Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK4Q9UBT3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK4Q9UBT3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms