Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPASTQ9UBP0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms