Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAE1Q9UBE0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAE1Q9UBE0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAE1Q9UBE0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms