Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP28Q9P2N2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARHGAP28Q9P2N2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP28Q9P2N2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms