Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNQ9P2M7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNQ9P2M7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNQ9P2M7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNQ9P2M7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGNQ9P2M7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CGNQ9P2M7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNQ9P2M7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNQ9P2M7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms