Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRBP1Q9P2E9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms