Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC46.53■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC46.53■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC46.53■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC46.53■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC46.53■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC46.5■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.04
CCDC180Q9P1Z9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC46.5■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC46.47■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
CCDC180Q9P1Z9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC46.43■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC46.41■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
CCDC180Q9P1Z9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC46.36■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC46.34■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
CCDC180Q9P1Z9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms