Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms