Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRN3Q9NYV6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms