Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM53CQ9NYF3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms