Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNAH9Q9NYC9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNAH9Q9NYC9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms