Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDND1Q9NY35 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDND1Q9NY35 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDND1Q9NY35 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDND1Q9NY35 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDND1Q9NY35 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDND1Q9NY35 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms