Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms