Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MCM9Q9NXL9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM9Q9NXL9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms