Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A12Q9NXJ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A12Q9NXJ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms