Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD8Q9NX08 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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