Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVL1

FAM86C1, Protein FAM86C1, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM86C1Q9NVL1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM86C1Q9NVL1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM86C1Q9NVL1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM86C1Q9NVL1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms