Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCF3Q9NUQ8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF3Q9NUQ8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms