Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTG1Q9NSN8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms