Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMSN1Q9NSI8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms