Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms