Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SALL1Q9NSC2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms