Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCND1Q9NSA2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms