Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HELLSQ9NRZ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms