Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARHGAP35Q9NRY4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms