Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK2Q9NRA0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms