Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYLDQ9NQC7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLDQ9NQC7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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