Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN4Q9NQC3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms